理事長
理事9人の中から選任された者
理事
校長、首座主教、評議員会から選任された者5人、学識経験者2人 
計9人
評議員
校長、首座主教、教職員3人、卒業生8人、学識経験者6人 
計19人
監事
2人
参与会
日本聖公会各教区主教 11人
校友会
卒業生と修了生によって組織され、現在会員数約300名。
校友会奨学金による神学生援助、諸行事の支援と協力などが主な事業です。